第三方物流独立管理的保税仓储业务是近年来新推出的保税物流业务，是海关总署基于保税货物高效进出口报关纳税的新型管理模式。在这种新的管理模式下，保税仓库可以设在保税区外，一些操作程序由海关分散，由第三方物流企业独立管理。海关可以随时检查仓库库存，并对保税仓库进行监管。

保税仓库每月向海关申报一次货物进出口清单，并与海关系统核对保税货物的库存，一次性纳税，大大简化了通关手续，加快了通关速度。这种管理模式特别适用于对时间和库存要求较高的维修备件保税库存业务。